Per unire sequenze di immagini (jpg, bmp, gif, tif etc.) in file video ci sono un sacco di programmi, TMPGEnc stesso lo fa, oppure programmi freeware specifici come per esempio JPGvideo
(
www.webattack.com/get/jpgvideo.html ) o altri.
Le mmagini dovrebbero essere tutte dello stesso tipo (jpg, gif etc.), quindi occorre convertire qualcosa.
Per quanto riguarda i file mp3, per unirli in maniera lossless puoi usare musiCutter, c'è una guida mia su technet, quella che si occupa di dividere lossless i file mp3 (lo stesso programma puo' anche unirli).
Ciao
Paolo