Vediamo se ci capiamo qualcosa :
Avevi un master C: con windows e uno slave D: con Debian.
Hai tolto Windows da C:
Puo' essere che con la disistallazione siano state riscritte boot e MBR?
Il grub dove era stato "allocato" ? Traccia MBR di C: ?
Se si', come fai ad avere ancora lo splash screen di Grub ? Ma soprattutto se ce l' hai come mai appunto non funziona?
Riesci a postare forse un fstab o meglio ancora un fdisk -l ? Magari usa una live per farlo.
Se sei pratico con una live puoi anche ripristinare il Grub.
qui trovi come farlo con il terminale
Anche se e' indicato come ripristino dopo istallazione di Windows il metodo si adatta anche al tuo caso.
Se invece hai invertito master e slave dovrai modificare anche l' fstab.
Direi che e' essenziale avere altri particolari.